Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm17175E9Q528 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm17175E9Q528 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm17175E9Q528 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm17175E9Q528 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm17175E9Q528 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm17175E9Q528 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm17175E9Q528 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gm17175E9Q528 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gm17175E9Q528 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gm17175E9Q528 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gm17175E9Q528 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gm17175E9Q528 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms