Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pde8bE9Q4S1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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