Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ApobE9Q414 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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