Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r238E9Q373 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r238E9Q373 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r238E9Q373 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r238E9Q373 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r238E9Q373 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms