Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zfp558E9Q1J0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms