Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm3893E9Q1I1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3893E9Q1I1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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