Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Myo5cE9Q1F5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Myo5cE9Q1F5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
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