Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms