Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0P0

Gm8127, Predicted gene 8127, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8127E9Q0P0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8127E9Q0P0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms