Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdr1E9Q0B4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms