Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ13

Gm10608, Predicted gene 10608, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10608E9PZ13 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10608E9PZ13 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10608E9PZ13 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms