Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Srp54bE9PXC0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp54bE9PXC0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms