Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc144bE9PVZ3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms