Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc62E9PVD1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms