Protein–RNA interactions for Protein: E9PUS4

Zfp944, Zinc finger protein 944, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp944E9PUS4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp944E9PUS4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms