Protein–RNA interactions for Protein: D3Z536

Gm8225, Predicted gene 8225, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8225D3Z536 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8225D3Z536 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8225D3Z536 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8225D3Z536 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8225D3Z536 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm8225D3Z536 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8225D3Z536 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms