Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim12cD3Z3L3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim12cD3Z3L3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms