Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2X2

Dnhd1, Dynein heavy chain domain 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnhd1D3Z2X2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnhd1D3Z2X2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnhd1D3Z2X2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnhd1D3Z2X2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnhd1D3Z2X2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnhd1D3Z2X2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnhd1D3Z2X2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnhd1D3Z2X2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Dnhd1D3Z2X2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Dnhd1D3Z2X2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dnhd1D3Z2X2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dnhd1D3Z2X2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dnhd1D3Z2X2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Dnhd1D3Z2X2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Dnhd1D3Z2X2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms