Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Defa28D3Z1V9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa28D3Z1V9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms