Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf217D3YYI7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rnf217D3YYI7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf217D3YYI7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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