Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Samd1D3YXK1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms