Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc13D3YV10 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc13D3YV10 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms