Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna7C0LLJ0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms