Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptprz1B9EKR1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptprz1B9EKR1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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