Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nxpe3B9EKK6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nxpe3B9EKK6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms