Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pdzd8B9EJ80 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pdzd8B9EJ80 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pdzd8B9EJ80 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd8B9EJ80 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms