Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11bB4XVQ1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms