Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm6133B2RY53 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm6133B2RY53 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms