Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pnldc1B2RXZ1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pnldc1B2RXZ1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms