Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc11B2RXC1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc11B2RXC1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms