Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cyp26c1B2RXA7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyp26c1B2RXA7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms