Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apba1B2RUJ5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apba1B2RUJ5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms