Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PtprbB2RU80 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms