Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc22a28B2RT89 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc22a28B2RT89 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms