Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm2012B1B0R1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm2012B1B0R1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms