Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU7

Gm13178, Predicted gene 13178, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13178B1AVU7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm13178B1AVU7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms