Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik3B1AS29 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms