Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms