Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm11127A7VMS2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm11127A7VMS2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm11127A7VMS2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm11127A7VMS2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm11127A7VMS2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm11127A7VMS2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm11127A7VMS2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm11127A7VMS2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm11127A7VMS2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm11127A7VMS2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm11127A7VMS2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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