Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll11A4Q9F4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll11A4Q9F4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms