Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E5

Ttll3, Tubulin monoglycylase TTLL3, mousemouse

Predictions only

Length 927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll3A4Q9E5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttll3A4Q9E5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll3A4Q9E5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms