Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm6880A3KG45 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Gm6880A3KG45 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gm6880A3KG45 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gm6880A3KG45 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gm6880A3KG45 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gm6880A3KG45 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gm6880A3KG45 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gm6880A3KG45 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gm6880A3KG45 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gm6880A3KG45 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gm6880A3KG45 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm6880A3KG45 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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