Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
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Atp8b5A3FIN4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b5A3FIN4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
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