Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms