Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rtf1A2AQ19 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rtf1A2AQ19 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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