Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prdm12A2AJ77 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm12A2AJ77 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms