Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2dnl2A2AFH2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms