Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Pramef6A2A8M8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Pramef6A2A8M8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Pramef6A2A8M8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Pramef6A2A8M8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pramef6A2A8M8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Pramef6A2A8M8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Pramef6A2A8M8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Pramef6A2A8M8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Pramef6A2A8M8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramef6A2A8M8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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