Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb4A2A863 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb4A2A863 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms