Protein–RNA interactions for Protein: A2A7V7

Cd300c, CMRF35-like molecule 6, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300cA2A7V7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd300cA2A7V7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd300cA2A7V7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms